Der Hauptausschuss setzt sich aus bis zu sechs Vertretenden zusammen, welche in der Jahresvollversammlung gewählt wurden, und dem:der Stadtjugendpfleger:in, als beratendes Mitglied. 

Der Hauptausschuss leitet die Arbeit des SJR und ist zuständig für Angelegenheiten, die von der Hauptversammlung übertragen wurden oder welche nicht ausschließlich der Hauptversammlung vorbehalten sind. Der Hauptausschuss bereitet Beschlüsse vor und nach.